Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF839A8K0R7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF839A8K0R7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF839A8K0R7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF839A8K0R7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms