Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm12A2AJ77 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms