Protein–RNA interactions for Protein: A2A5X4

Krtap29-1, Keratin-associated protein 29-1, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap29-1A2A5X4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap29-1A2A5X4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms