Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B638

Trav4-2, T cell receptor alpha variable 4-2 (Fragment), mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav4-2A0A075B638 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Trav4-2A0A075B638 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trav4-2A0A075B638 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Trav4-2A0A075B638 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trav4-2A0A075B638 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trav4-2A0A075B638 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trav4-2A0A075B638 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav4-2A0A075B638 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav4-2A0A075B638 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav4-2A0A075B638 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav4-2A0A075B638 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav4-2A0A075B638 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav4-2A0A075B638 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav4-2A0A075B638 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trav4-2A0A075B638 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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