Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt6bQ9Z331 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt6bQ9Z331 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt6bQ9Z331 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt6bQ9Z331 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt6bQ9Z331 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt6bQ9Z331 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt6bQ9Z331 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt6bQ9Z331 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt6bQ9Z331 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt6bQ9Z331 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt6bQ9Z331 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt6bQ9Z331 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt6bQ9Z331 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt6bQ9Z331 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt6bQ9Z331 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt6bQ9Z331 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt6bQ9Z331 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt6bQ9Z331 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt6bQ9Z331 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms