Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Thbs4Q9Z1T2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thbs4Q9Z1T2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms