Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms