Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PrkraQ9WTX2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms