Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SCN8AQ9UQD0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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