Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGSF9BQ9UPX0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF9BQ9UPX0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms