Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM35Q9UPQ4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM35Q9UPQ4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
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