Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX7Q9UNH6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms