Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEF1Q9UBV8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEF1Q9UBV8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEF1Q9UBV8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEF1Q9UBV8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEF1Q9UBV8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEF1Q9UBV8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEF1Q9UBV8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEF1Q9UBV8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEF1Q9UBV8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEF1Q9UBV8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEF1Q9UBV8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEF1Q9UBV8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEF1Q9UBV8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEF1Q9UBV8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEF1Q9UBV8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEF1Q9UBV8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEF1Q9UBV8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEF1Q9UBV8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEF1Q9UBV8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEF1Q9UBV8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEF1Q9UBV8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEF1Q9UBV8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEF1Q9UBV8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PEF1Q9UBV8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PEF1Q9UBV8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEF1Q9UBV8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms