Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ubxn8Q9QZ49 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms