Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr2e3Q9QXZ7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms