Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMC4Q9NTJ3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMC4Q9NTJ3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms