Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HOMER2Q9NSB8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms