Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2l2Q9JLG4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms