Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnot9Q9JKY0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms