Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp4Q9JKV5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Scamp4Q9JKV5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms