Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pard6bQ9JK83 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms