Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rpgrip1Q9EPQ2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms