Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SyncQ9EPM5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SyncQ9EPM5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SyncQ9EPM5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SyncQ9EPM5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SyncQ9EPM5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SyncQ9EPM5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SyncQ9EPM5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SyncQ9EPM5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SyncQ9EPM5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SyncQ9EPM5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SyncQ9EPM5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SyncQ9EPM5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SyncQ9EPM5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SyncQ9EPM5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SyncQ9EPM5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SyncQ9EPM5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SyncQ9EPM5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SyncQ9EPM5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SyncQ9EPM5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SyncQ9EPM5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SyncQ9EPM5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SyncQ9EPM5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SyncQ9EPM5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SyncQ9EPM5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SyncQ9EPM5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SyncQ9EPM5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SyncQ9EPM5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SyncQ9EPM5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SyncQ9EPM5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms