Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf6Q9DBU5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf6Q9DBU5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms