Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD6

Pfn3, Profilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn3Q9DAD6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfn3Q9DAD6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfn3Q9DAD6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 510.2 ms