Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdzd9Q9D9M4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdzd9Q9D9M4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdzd9Q9D9M4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms