Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tspan17Q9D7W4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms