Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V2

Lysmd2, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd2Q9D7V2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lysmd2Q9D7V2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lysmd2Q9D7V2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lysmd2Q9D7V2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lysmd2Q9D7V2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lysmd2Q9D7V2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lysmd2Q9D7V2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lysmd2Q9D7V2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lysmd2Q9D7V2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lysmd2Q9D7V2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lysmd2Q9D7V2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lysmd2Q9D7V2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lysmd2Q9D7V2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lysmd2Q9D7V2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lysmd2Q9D7V2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lysmd2Q9D7V2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lysmd2Q9D7V2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lysmd2Q9D7V2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lysmd2Q9D7V2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lysmd2Q9D7V2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lysmd2Q9D7V2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lysmd2Q9D7V2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lysmd2Q9D7V2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lysmd2Q9D7V2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lysmd2Q9D7V2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lysmd2Q9D7V2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lysmd2Q9D7V2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lysmd2Q9D7V2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lysmd2Q9D7V2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lysmd2Q9D7V2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lysmd2Q9D7V2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms