Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Capns2Q9D7J7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capns2Q9D7J7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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