Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chmp4cQ9D7F7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp4cQ9D7F7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms