Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Speer4f1Q9D5Q6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4f1Q9D5Q6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms