Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D4W2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D4W2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D4W2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D4W2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D4W2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9D4W2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms