Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C5

Eaf1, ELL-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eaf1Q9D4C5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eaf1Q9D4C5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eaf1Q9D4C5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eaf1Q9D4C5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eaf1Q9D4C5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eaf1Q9D4C5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms