Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms