Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR22

Tmem42, Transmembrane protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem42Q9CR22 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem42Q9CR22 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem42Q9CR22 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem42Q9CR22 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem42Q9CR22 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem42Q9CR22 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem42Q9CR22 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem42Q9CR22 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem42Q9CR22 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem42Q9CR22 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem42Q9CR22 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem42Q9CR22 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem42Q9CR22 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem42Q9CR22 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem42Q9CR22 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem42Q9CR22 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem42Q9CR22 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem42Q9CR22 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem42Q9CR22 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem42Q9CR22 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem42Q9CR22 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem42Q9CR22 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem42Q9CR22 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem42Q9CR22 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem42Q9CR22 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem42Q9CR22 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem42Q9CR22 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem42Q9CR22 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem42Q9CR22 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms