Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg12Q9CQY1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms