Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL5

Mrpl18, 39S ribosomal protein L18, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl18Q9CQL5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl18Q9CQL5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl18Q9CQL5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms