Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ39

Med21, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med21Q9CQ39 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Med21Q9CQ39 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med21Q9CQ39 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med21Q9CQ39 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med21Q9CQ39 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med21Q9CQ39 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med21Q9CQ39 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med21Q9CQ39 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med21Q9CQ39 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med21Q9CQ39 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med21Q9CQ39 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med21Q9CQ39 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med21Q9CQ39 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med21Q9CQ39 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med21Q9CQ39 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med21Q9CQ39 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med21Q9CQ39 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med21Q9CQ39 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms