Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
HIRIP3Q9BW71 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HIRIP3Q9BW71 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms