Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU7

Bap1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap1Q99PU7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bap1Q99PU7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bap1Q99PU7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.9 ms