Protein–RNA interactions for Protein: Q99M03

Rwdd2b, RWD domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd2bQ99M03 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rwdd2bQ99M03 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rwdd2bQ99M03 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rwdd2bQ99M03 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rwdd2bQ99M03 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rwdd2bQ99M03 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rwdd2bQ99M03 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rwdd2bQ99M03 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rwdd2bQ99M03 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms