Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf19Q99KP6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms