Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH7

Clstn3, Calsyntenin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3Q99JH7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clstn3Q99JH7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn3Q99JH7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms