Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS6KC1Q96S38 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms