Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atl3Q91YH5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atl3Q91YH5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms