Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIK3

H1foo, Histone H1oo, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1fooQ8VIK3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H1fooQ8VIK3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H1fooQ8VIK3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms