Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG6

Cnot6l, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6lQ8VEG6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot6lQ8VEG6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot6lQ8VEG6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot6lQ8VEG6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot6lQ8VEG6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot6lQ8VEG6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot6lQ8VEG6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot6lQ8VEG6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot6lQ8VEG6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot6lQ8VEG6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot6lQ8VEG6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnot6lQ8VEG6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms