Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND25

ZNRF1, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF1Q8ND25 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF1Q8ND25 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNRF1Q8ND25 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms