Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5M1

ATPAF2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPAF2Q8N5M1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATPAF2Q8N5M1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATPAF2Q8N5M1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATPAF2Q8N5M1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATPAF2Q8N5M1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATPAF2Q8N5M1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATPAF2Q8N5M1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATPAF2Q8N5M1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATPAF2Q8N5M1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPAF2Q8N5M1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPAF2Q8N5M1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPAF2Q8N5M1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPAF2Q8N5M1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPAF2Q8N5M1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPAF2Q8N5M1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPAF2Q8N5M1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPAF2Q8N5M1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPAF2Q8N5M1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPAF2Q8N5M1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPAF2Q8N5M1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPAF2Q8N5M1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPAF2Q8N5M1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPAF2Q8N5M1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPAF2Q8N5M1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPAF2Q8N5M1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPAF2Q8N5M1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATPAF2Q8N5M1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms