Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3A2

Trpt1, tRNA 2'-phosphotransferase 1, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpt1Q8K3A2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trpt1Q8K3A2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpt1Q8K3A2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trpt1Q8K3A2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpt1Q8K3A2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpt1Q8K3A2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trpt1Q8K3A2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpt1Q8K3A2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpt1Q8K3A2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trpt1Q8K3A2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trpt1Q8K3A2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trpt1Q8K3A2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Trpt1Q8K3A2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Trpt1Q8K3A2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Trpt1Q8K3A2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trpt1Q8K3A2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trpt1Q8K3A2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trpt1Q8K3A2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trpt1Q8K3A2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trpt1Q8K3A2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trpt1Q8K3A2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trpt1Q8K3A2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trpt1Q8K3A2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trpt1Q8K3A2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trpt1Q8K3A2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trpt1Q8K3A2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trpt1Q8K3A2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Trpt1Q8K3A2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpt1Q8K3A2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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